Le passage de l'endoderme vers la vésicule ombilicale est fortement rétréci par les flexions crâniale et caudale. Ce passage est délimité en direction des intestins antérieur et postérieur par, respectivement, les orifices intestinaux antérieur et postérieur. C'est dans cette région délimitée par les orifices intestinaux que se développe l'intestin moyen.