A droite du septum primum se forme le septum secundum qui croît le long d'un axe oblique de crânio-ventral vers dorso-caudal, c'est-à-dire perpendiculairement à l'axe de croissance du septum primum (S18 à S21). Il reste encore une ouverture ovale (foramen oval) entre le bord libre du septum secundum et le bord du foramen secundum. Ce n'est qu'au S23 que le septum secundum recouvre complètement le foramen secundum. Cependant, du sang continue à circuler de l'oreillette droite vers l'oreillette gauche parce que, due à la différence de pression entre les deux oreillettes, le septum primum est dévié vers la gauche ; ainsi un foramen ovale fonctionnel est maintenu (animation : cloisonnement de l'oreillette).
Le nœud sinusal (nœud sino-atrial) est intégré, ensemble avec le sinus veineux, dans la paroi dorsale de l'oreillette droite (S13). L'oreillette gauche recueille les veines pulmonaires. Ces dernières livrent la paroi postérieure lisse de l'oreillette gauche.