La racine dentaire ne se forme qu'une fois les substances dures de la couronne tout à fait en place. Les épithéliums adamantins externe et interne s'apposent dans leur zone de réflexion et forment le manchon radiculaire épithélial. Le nombre de colonnes épithéliales correspond au nombre de racines. Dans la région de la future pointe radiculaire, l'extrémité du manchon radiculaire se courbe vers le centre. Il se forme ainsi un diaphragme délimitant la papille dentaire (diaphragme de la gaine radiculaire) et possédant un orifice (pore). A travers cet orifice, la papille dentaire est en contact avec son environnement par des vaisseaux et des nerfs. Quand le manchon radiculaire pénètre dans le mésenchyme, il se forme, à partir du mésenchyme de cette région, des odontoblastes qui produisent la dentine radiculaire. Par la suite, le manchon radiculaire épithélial est éliminé.
Dans la couche interne du saccule dentaire (lamina cementoblastica) en regard de l'ébauche dentaire se différencient les cémentoblastes, qui forment le cément, et lequel se dépose sur la dentine radiculaire. Le cément entre en contact avec l'émail au niveau du collet. L'os alvéolaire se forme à partir de la couche externe du saccule dentaire (lamina osteoblastica). Le périodonte provient de la partie intermédiaire du saccule dentaire (lamina periodontoblastica). Les fibres périodontales collagènes (fibres de Sharpey) relient l'os alvéolaire au cément dentaire.