Diencéphale

Chez l'embryon de 7 semaines, une évagination à la base du diencéphale mène à la formation de l'infundibulum. Ce dernier avoisine immédiatement la protrusion ectodermique de la dépression buccale (la poche de Rathke). A partir de cette poche se développe l'adénohypophyse et à partir de l'infundibulum, la neurohypophyse ainsi que la tige hypophysaire. Vers la fin de la période embryonnaire, on peut observer que les fibres optiques commencent à se croiser (chiasma optique) dans la paroi antérieure du diencéphale, en dessous de la lamina terminalis. Sur la face dorsale, on assiste à la protrusion de l'épiphyse (corps pinéal, S16).

Mésencéphale

Le mésencéphale s'est fortement incurvé. A la zone de transition vers le rhombencéphale, il s'est rétréci en un isthme. Au S15, on peut apercevoir le nerf oculomoteur dans la concavité et dorsalement, dans la région de l'isthme, le nerf trochléaire.