Chez l'embryon de 8 semaines, la plaque urétrale s'épaissit sur son côté ventral et se dissout à l'intérieur. C'est ainsi que se forme la fosse urétrale secondaire (sulcus urogenitalis definitivus), qui approfondit la fosse primaire. C'est également la raison pour laquelle cette fosse urétrale définitive est tapissée en partie d'entoderme et en partie d'ectoderme. Elle est en contact avec la portion phallique du sinus uro-génital. Le sexe peut être déterminé sans ambiguïté dès la 9ème semaine.