Le canal excrétoire commun est la voie excrétoire commune pour le canal mésonéphrotique et l'uretère. Il débouche dans le sinus uro-génital primaire et sera complètement intégré avec le temps dans la paroi postérieure de celui-ci. Le canal mésonéphrotique et l'uretère s'ouvrent alors séparément dans le sinus uro-génital. Les embouchures des canaux mésonéphrotiques marquent la limite entre le canal vésico-urétral et le sinus uro-génital définitif (S17). Par la suite, les embouchures des uretères sont déplacées en directions crâniale et latérale. Les orifices des canaux mésonéphrotiques restent proches l'un de l'autre et se déplacent probablement en direction caudale (S18). La partie triangulaire de la paroi vésicale postérieure (trigone vésical) entre les uretères et les canaux mésonéphrotiques provient vraisemblablement du canal mésonéphrotique. Elle est par conséquent d'origine mésodermique. Le reste de la vessie est d'origine endodermique.